2008年汶川地震时，她曾连续奋战42天，带领战友们向重灾区空投700多吨救灾物资。

　　据《中华儿女》杂志报道，2008年5月12日，程晓健受命飞赴成都，出任空军运输航空兵某师副师长。

　　当她所乘的飞机飞临成都上空时，那场巨大的灾难突然发生了，飞机改降西安。直至5月14日零点35分，程晓健所乘坐的飞机才抵达成都。　

　　程晓健在最短时间内赶到成都空军报到。之后负责在机场指挥部协调、指挥、分配空军大型运输机的抗震救灾任务。　

　　“很多时候是在没有风向风速数据、没有人工标示地面标志、没有人员指挥地面引导的前提下，程晓健指挥的空军救援部队接连成功实施盲投，创造了很多世界空投史上也没有的先例。”

　　2009年，程晓健被任命为驻蓉运输航空兵某师师长，成为自1949年新中国成立以来中国空军第一位女师长，师级战斗单位的最高军事指挥首长。